Pada tahun 1956, Goulart dilantik sebagi Timbalan Presiden kepada Juscelino Kubitschek. Beliau diundi semula pada 1960 sebagai timbalan Jânio Quadros yang berpada dalam partai politik yang berbeza. Quadros meletakkan jawatan presidennya pada 1961 agar dapat membuat suatu penggulingan kuasa sendiri, lalu memudahkan João mengambil alih sebagai presiden. Keadaan ini tidak disenangi segelintir negarawan yang menganggapnya terlalu radikal dalam fahamannya. Kongres Brazil turut teragak-agak menerima hal ini namun suatu kompromi dapat dicapai, dan akhirnya João dapat menduduki jawatan presiden namun dalam suatu sistem berparlimen - beliau mendapat kuasa eksekutif sepenuhnya setelah suatu pungutan suara perlembagaan pada tahun 1963 sebulat suara menolak sistem ini.[petikan diperlukan]